Церковь во имя Казанской Божией Матери просуществовала до начала 20-х годов прошлого столетия. После передачи монастыря в 1917 году советской власти храм был разорен. Неоднократно его внутреннее помещение подвергалось перестройке. Речь о реставрации Казанской церкви зашла лишь после возвращения Николо-Угрешского монастыря Русской Православной Церкви. В 2000 году, после восстановления и освящения Спасо-Преображенского собора – главного собора обители, встал вопрос о воссоздания и других ее храмов.
Когда в Казанской церкви были демонтированы возведенные в советское время перегородки, перед взором открылось просторное помещение удивительной архитектурной формы, по площади своей не уступающее Успенскому храму. В 2008 году завершились все ремонтно-реставрационные работы. Установлен иконостас из красного дерева.
После долгих десятилетий забвения в Казанской церкви вновь зазвучало слово Божие. 20 июля 2009 года, на праздник Влахернской иконы Божией Матери, в Николо-Угрешском монастыре состоялось малое освящение воссозданной Казанской церкви.
